第10集 - 潛行狙擊！新幹線戰士E3翼號
巨型怪物體現身山形，E5與E7因路軌問題無法抵達，故由秋田獨自出動。秋田不敵之際，局部地區專用的E3現身相救，駕駛員是自稱忍者的少年月山忍。同樣在山上長大的兩人打破隔閡，聯手對抗敵人。

第09集 - 熱鬥！超進化研究所溫泉旅行
雙葉向出水尋求工作上的意見，對方卻提出研究所全體來一場溫泉旅行。出水聲稱去尋找隱世溫泉，敵人卻在此時出現，雙葉擔起指揮重任，阿貫因其指示受傷，令雙葉失去自信，卻不知敵人已悄悄復活。

第08集 - 連結！第一次的連結合體
北斗前往京都後，隼人顯得精神緊張，車長寶希望加以扶持，結果弄巧反拙，兩人吵架不和。這次的敵人由火構成，沒有實體，如要將之擊敗，必須進行連結合體，儘管訓練未嘗成功，隼人依然決定一試。

第07集 - 齊心協力！隼人是個孝順兒子
擁有分裂能力的星流怪出現，隼人等雖勉強取勝，卻突顯出合作不足的問題。北斗接獲通知，被調動去京都協助設立新據點。敵人同時派出三隻星流怪，如要一氣過將敵人殲滅，三名駕駛員必須通力合作。

第06集 - 貫穿！新幹線戰士E7光輝號
貫輝表示自己不能駕駛新幹線戰士，隼人與秋田於是前往金澤望能說服對方。原來貫輝家裡開建築公司，父親離世令身為長子的他自覺要為家裡出力。經過母親鼓勵後，貫輝決定成為駕駛員，誓要奪回蒸汽火車。